本学科是医学教育、科研及临床疾病诊断领域中的重要学科之一，病理系任务除教学、及科研外，还担负着繁重的临床诊断的任务。病理系由第一临床医院（宣武）、第二临床医院（友谊）、第四临床医院（同仁）及基础病理室组成。教授15人、副教授19人。本学科具有老中青结合的学术梯队，博士毕业四名为学科主要带头人，病理界德高望重的老专家，均担任病理解剖及病理生理重要职务。

　　九五期间获得资助基金239万，获国家教委科学技术二等奖1项，北京市科学技术进步二等及三等奖分别1项及4项。

　　研究方向：1、眼、耳鼻喉疾病病理研究：应用超微技术及分子生物学方法对眼、耳鼻喉、头颈部肿瘤及特殊感染症的病因病理学进行研究，取得了初步的成果。2、以肿瘤病理研究为中心的临床病理研究：（1）神经系统肿瘤、感染、血管病、脱髓鞘病及老年变性病等病理学诊断及科研方面已经形成特色神经病理诊断和研究方面居全国领先地位。（2）应用分子生物学技术、原位杂交技术检测肿瘤基因缺失、融合基因、病原体及癌基因，提高病理诊断和科研的水平。3、动物实验病理学研究 制作与人类疾病有关的动物实验模型。通过较为先进的研究方法，对心血管系统疾病进行深入研究，RGDS抗血栓形成作用的研究居于国内领先地位。