本学科在我校已近二十年的历史，主要研究方向是将现代的工程技术与生物医学实际相结合、基础与临床相结合的新技术与新方法。与临床更紧密结合，解决临床中急需解决的问题。目前的研究方向：生物医学信号处理与生物信息控制；医学图象处理与分析；临床医学影像分析及质量控制。主要进行医学信息处理方法学的研究。生物神经系统信息加工的建模与仿真、多模医学图象配准、医学图象的融合技术、临床医学影像分析及质量控制、生物组织本构关系的研究等是当前的主要研究课题。在断层扫描医学图象研究、眼动信号仿真、人工神经网络技术等专题研究达到国内一流水平，部分研究成果引起国际同行关注。

　　本学科曾获北京市科技进步奖一等奖2项、二等奖3项、省部奖3项、三等奖10余项，在九五期间已经和正在承担的国家、省部级课题46项，处于国内先进水平。自1999年开始在全国率先开办生物医学工程专门化教育（临床听力工程，临床影像工程），使本学科的教育更具特色，科研和教学水平处于全国高等医药院校生物医学工程专业的第一梯队。